宁夏医科大学总医院药物临床试验机构在医院是一具有独立运作的，有管理职能的业务科室，主要职责是服务、监管、协调和培训，业务是以注册为目的药物、医疗器械和体外诊断试剂临床试验进行的立项管理、方案审核、经费/合同审核、质量管理、总结报告审核签章等工作。

宁夏医科大学总医院药物临床试验机构于2009年1月获得国家食品药品监督管理总局资格认定，并分别于2012年7月和2017年3月通过复核检查，且接受过多次的国家药品监督管理局组织的现场数据核查。

目前在国家药品监督管理局的“药物临床试验机构备案管理信息平台”中备案有呼吸、心血管、消化、肿瘤（内科、外科、放疗科）、耳鼻咽喉、妇科、骨科、麻醉（疼痛）、泌尿外科、内分泌、神经内科、眼科、急诊、神经外科、肾病学、感染性疾病科、儿内科、新生儿专业、皮肤科、风湿免疫科共20个临床专业和I期药物临床研究室。在“医疗器械临床试验机构备案管理信息系统”中备案有呼吸、消化、神经内科、心血管、普外科、骨科、妇科、耳鼻咽喉、口腔、急诊、医学实验中心、神经电生理、中医骨伤科、麻醉（疼痛）共14个专业。